圣玛尔定一世是意国多斯加纳人。未任教宗前他的才德在罗马已受到人们的注意。他作六品副祭的时候，由教宗伯多禄委派赴君士坦丁堡任教廷特使。
玛尔定于公元649年7月当选继任，荣登伯多禄的宝座。
同年10月，玛尔定在拉特郎举行教务会议，宣布“基督一意论”为异端，同时谴责罗马皇帝直接或间接指证“基督一意论”异端的两道诏书。在第一道诏书里，君士坦丁二世皇帝承认“基督一意论”异端是正确的。在第二道诏书里，皇帝禁止双方提起基督有“一个”意志或“二个”意志。拉特郎会议宣称：“真理与谬论不能并存，我们不能采取模棱两可的态度。”
拉特郎会议的决议案在西方各地公布。玛尔定教宗获得非洲、西班牙、英国主教的协助，攻斥“基督一意论”的异端。在东方，他独得安提阿宗主教和耶路撒冷宗主教的协助。
君士坦丁二世皇帝知道了拉特郎会议的决议案，大为震怒，派人到罗马去用武力将教宗劫持解往君士坦丁堡。玛尔定那时虽然患病甚重，但他很镇静地留在拉特郎大堂，在祭台前摊了一个垫子，坐在上面。皇帝的兵士进入圣堂将教宗劫走，搭船往君士坦丁堡。
海上航行，费了很长的时间，玛尔定患痢疾痛苦不堪。653年秋季到了君士坦丁堡，在监狱里幽禁了3个月。他在狱中写信给教友说： “我已经47天不准用水洗身，我现在已经没有力气了。监狱里的食物恶劣不堪，我希望将来死了以后，天主赏赐迫害我的人悔罪改过。”
3月后，玛尔定被提往参议院。举行公审。表面上的罪名是叛国罪，实际的罪名是因为他不肯接受异端。玛尔定度了3个月的铁窗生活，然后充军到色雷斯。玛尔定在流亡之地写信给朋友，描述他所受的种种痛若。信末最后一段说：“我求天主赏赐大家坚守信德。我个人的生命，算不了什么。”
玛尔定于公元656年逝世。